2022年7月17日,我院2020级本科生蒋济慈负责的大创团队科研成果“Identify Bitter Peptides by Using Deep Representation Learning Features”在《International Journal of Molecular Sciences》在线发表(全文链接:https://www.mdpi.com/1422-0067/23/14/7877)。
苦味是大多数动物和人类趋利避害的信号,蛋白质的苦味往往源自苦味肽的存在。本文基于深度学习预训练神经网络特征提取方法,提出了一种机器学习的苦味肽预测方法iBitter-DRLF。文中使用特征融合及三种序列嵌入技术(SSA、UniRep和BiLSTM),基于机器学习算法以构建多个模型。实验结果表明,深度表示学习的使用大大提高了模型识别苦味肽的能力,实现了仅基于肽序列数据的准确预测。iBitter-DRLF对于改善药物摄入的依从性和推动营养开发有着积极作用,其网络服务器可在线获取。
本文的通讯作者为该大创团队的指导老师生物医学工程学院吕志彬副研究员,第一作者为生物医学工程学院2020级本科生蒋济慈,第二作者为软件工程学院2020级本科生林新旭,第三作者为华西临床医学院2021级本科生姜月琦。该项目得到国家自然科学基金、四川大学中央高校基本科研业务费专项资金和省级大创《基于序列深度表示学习的苦味肽预测》的资助。